华体会网站赞助了皇马:园艺学院张忠华研讨团队发布葱属比较基因组学和功用基因组学数据库

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　　近来，青岛农业大学园艺学院张忠华研讨团队在世界闻名期刊Horticulture Research宣布题为 AlliumDB: A central portal for comparative and functional genomics in Allium的研讨论文。该研讨经过整合葱属多个物种的基因组、转录组、变异组、表型组等数据，构建了一个葱属比较基因组学和功用基因组学数据库，为葱属作物遗传育种研讨供给了重要的数据资源和剖析渠道。

　　葱属（AlliumL.）是单子叶植物中最大的属之一，包括许多经济上重要的蔬菜如洋葱、大蒜、葱和韭菜等。葱属植物具有相对较大的基因组（10–30 Gb），约束了全基因组水平上对农艺性状的解析，尽管近年来基因组、变异组、转录组、蛋白组等数据快速堆集，但现在没有有一个全面、体系的葱属多组学数据整合和剖析渠道，严峻阻止了功用基因的发掘和分子育种进程。

　　为此，研讨团队开发了葱属比较基因组学和功用基因组学数据库AlliumDB（）。该数据库包括葱属物种核和细胞器基因组、集体遗传变异、基因表达谱和共表达网络、蛋白丰度、共线性区块和同源基因、体系的基因功用注释、种质资源表型相片和性状记载，并供给了多样的查询方法，以交互的可视化和表格展现查询成果。一起，还集成了JBrowse基因组浏览器、BLAST比对、序列提取、基因表达热图制作、GO/KEGG/基因宗族功用富集和motif剖析等有用的剖析东西和下载中心，将有利于说明葱属作物要害性状的分子机制，以拟定未来的最佳育种战略。

　　该研讨得到了国家自然科学基金、山东省人民政府“泰山学者”基金、山东省自然科学基金及山东省高等学校青创人才引育项目的赞助。青岛农业大学园艺学院在读硕士研讨生杨鹏涛、原玉为论文榜首作者，青年教师刘悦、张忠华教授和吕丙盛教授为论文通讯作者。课题组青年教师闫超、贾越、本科生娄奥、扬州大学农学院青年教师尤琪、西北师范大学生命科学学院达玲玲副教授也参加了相关作业。